Um neu zu starten musst Du nicht "shutdown" sondern "reboot" aufrufen.
Wenn Du auch andere SatIP Geräte verwendest, kann es sein, dass Du mehr Verbindungen aufgebaut hast, als Empfänger. Dann würde das "standby" Gerät seine Verbindung verlieren. Ein Umschalten hilft dann aber.
Ein einfacher "modprobe vtunerc" wird nichts ändern, da die Module ja beim Booten bereits geladen wurden. Was aber helfen könnte, ist ein Neustart der vtuner-satip Dienste. Davon gibt es für jedes satip Device einen. "systemctl status vtuner*" sollte Dir alle auflisten. Zum testen einfach den VDR stoppen "systemctl stop vdr" dann die dienste neu starten, und anschließend den VDR wieder starten "systemctl start vdr"