Das Webif hatte den Reboot nach der Änderung der Tuner-Anzahl angefordert (und auch bekommen). Der Start des VDR hat dann sehr lange gedauert, weil die Systemd-Service nicht sauber hoch kamen. Mit Deiner Erläuterung ist das klar: Hier sind zwei SATIP-Server aktiv, der "kleine" SATIP-Server hat nur zwei Devices und durch die Umkonfiguration wurden da drei Tuner angefordert -> eine Anforderung ist in Timeout gelaufen.
Das ist wohl eine sehr spezielle Race-Condition, dürfte nicht häufig vorkommen, kann so bleiben.